Universitas Patompo membina 11 prodi, ada 9 jenjang S1 dan 2 jenjang S2. Prodi S1 yakni S1 Pendidikan Ekonomi; S1 Pendidikan Biologi; S1 Pendidikan Matematika; S1 Manajemen; S1 Akuntansi; S1 Ekonomi Pembangunan; S1 Teknik Sipil; S1 Teknik Elektro; S1 Statistika. Prodi Magister yakni S2 Pendidikan Ekonomi dan S2 Pendidikan Biologi.Kekuatan sumber daya dosen mencapai 150 dosen dengan jenjang jabatan fungsional ada 1 Guru Besar, 10 Lektor Kepala dan sisanya Lektor dan Asisten Ahli. Saat ini yang jadi Rektor Universitas Patompo adalah Prof Dr. H. Muh Yunus, M.Pd didampingi Wakil Rektor I, II dan III yakni Drs. H. Ahmad Hasyim, M.Si; Dr. Rahmawati, SE, M.Si; dan Dr. Muh Sri Yusal, S.Si, M.Si. Direktur Program Pascasrajana, Dr. Elpisah, SE, M.Pd. (*)
