Selama ini ada tiga program studi favorit jadi pilihan bagi para mahasiswa baru. Ketiga program studi itu yakni; S1 Ilmu Manajemen, S1 Pendidikan Ekonomi dan S1 Ilmu Biologi.Universitas Patompo menyelenggarakan 10 program studi sarjana dan magister, yakni Pendidikan Ekonomi Program Magister ( S2) Program Pendidikan Ekonomi (S1 ), Pendidikan Biologi ( S1 ), Pendidikan Metematika ( S1 ), Manajemen ( S1 ), Akuntansi ( S1 ), Ekonomi Pembangunan ( S1 ), Teknik Sipil ( S1 ), Teknik Elektro ( S1 ) dan Statistik ( S1).Saat ini yang jadi Ketua Yayasan Pembangunan Indonesia Makassar ( YASPIM ) Universitas Patompo, Andy Chaeruddin Patompo. Rektor Universitas Patompo didampingi Wakil Rektor I, Drs H. Ahmad Hasyim, M.Si; Wakil Rektor II, Dr Rahmawati, SE, M.Si; Wakil Rektor III, Dr. M. Sri Yusal SSi MSi.
Rektor Universitas Patompo, Prof Dr Drs H Muh Yunus M.Pd.
